Passer d’un fichier de l’ODS TAGSET.EXCELXP à un data set SAS avec PROC IMPORT

Le programmeur SAS pourra recueillir des informations d’un non spécialiste en créer un fichier Excel. Il importe ensuite les données sous SAS.

Dans un précédent sujet « Mes 1ers pas avec ODS TAGSET.EXCELXP« , nous avons vu comment créer un fichier Excel, ou plutôt un fichier XML lisible sous Excel, à partir de la syntaxe d’ODS TAGSET.EXCELXP.

Maintenant, il s’agit de voir les limites de l’importation d’un fichier XML avec la procédure PROC IMPORT.

Exemple : Nous aurons un fichier LST_STUDY.XLS avec plusieurs feuillets, dont un nommé ‘2000’, comme exemple. Ce feuillet a deux colonnes : le numéro de l’étude (STUDY) et la variable à compléter manuellement (FLAG_EXTERNAL). La première ligne contient le nom de la colonne. La variable STUDY peut contenir des nombres et du texte.

1. PROC IMPORT a besoin de données Excel

Même si le fichier créé par ODS TAGSET.EXCELXP a une extension .xls, ce fichier est en fait un fichier en langage XML. Comment observer cette information ? Voici deux propositions :

1. Ouvrez un fichier de ce type sous Excel et regarder le type lors que la fenêtre OUVRIR apparaît.
2. Ouvrez le fichier dans un éditeur de texte

Afin d’utiliser la procédure PROC IMPORT, il faudra donc convertir le fichier en « enregistrant sous » et là choisir le standard Excel.

2. Les options de l’instruction PROC IMPORT

Préciser le nom du fichier d’entrée et celui de sortie : Dans l’instruction PROC IMPORT, le nom du fichier Excel est donné avec l’option DATAFILE=; celui du data set SAS est introduit par l’option OUT=. Pour rendre ce data set permanent, le nom de la bibliothèque précédera le nom du data set comme d’habitude.

Indiquer à SAS le type de fichier à lire : Selon l’environnement et la version Excel utilisée, l’option DBMS= variera. DBMS=XLS est l’option que j’utilise sous Unix et Windows pour Excel2003. Reportez-vous à la documentation en ligne PROC IMPORT Statement) pour connaître toutes les valeurs possibles de cette option.

Remplacer un fichier SAS existant : Si le data set SAS existe déjà, il ne sera pas remplacé, à moins d’ajouter l’option REPLACE.

%let resultats = C:/sasref;

proc import datafile = « &resultats./lst_study.xls »
            out      = lst_study
            dbms     = xls
            replace;
run;

3. Les Instructions sur les données sources

Après avoir vu les options de l’instruction PROC IMPORT, je vous propose trois instructions supplémentaires de la procédure (SAS Online Doc. : Data Source Statements)

Des noms de variables personnalisés avec GETNAMES=YES : SAS se sert de la première ligne du fichier Excel pour définir le nom des variables SAS à moins que l’instruction GETNAMES=NO soit ajoutée.

SAS considère les premières lignes du fichier pour identifier le type des variables sauf si MIXED=YES : Si on a une combinaison de caractères et chiffres, on peut se retrouver avec des valeurs manquantes. Par exemple, si vous avez une variable année contenant les valeurs 2008, 2007, <2007, il faudra importer les variables sous forme de caractère. L’instruction MIXED=YES fera le travail pour vous. 

Importer une feuille de calcul en particulier grâce à SHEET=: Par défaut, SAS importera la première feuille de calcul disponible dans le fichier Excel. Pour choisir un autre feuillet, son nom est donné entre guillemets dans l’instruction  SHEET=.

%let resultats = C:/sasref;

proc import datafile = « &resultats./lst_study.xls »
            out      = lst_study
            dbms     = xls
            replace;
   *getnames = yes;
   mixed    = yes;
   sheet    = ‘2000’;
run;

Vous trouverez plus d’informations sur la procédure PROC IMPORT dans l’aide en ligne : SAS Online Doc, The IMPORT Procedure.

4. Une spécificité de l’ODS TAGSET.EXCELXP à gérer

Lors de la création du fichier avec ODS TAGSET.EXCELXP, une ligne est parfois ajoutée après la dernière ligne de saisie. Cette ligne est incluse dans le data set SAS à l’importation. La raison pour laquelle cette ligne est saisie m’est inconnue.

Par contre, je vous propose un data step pour vous en débarrasser une fois le data set SAS créé. 

• L’option END= de l’instruction SET sert à repérer la dernière ligne d’observations.
• La fonction MISSING permet de ne supprimer la ligne que si notre variable STUDY est vide.

data lst_study;
   set lst_study end=eof;
   if eof and missing(study) then delete;
run;