Archive for the ‘Intructions globales’ Category

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Des options pour se débarrasser de WARNING de SAS 9.2

août 18, 2010

Avec SAS 9.1.3 et SAS9.2 de nouveaux warning apparaissent. En voici deux que vous pouvez faire disparaître dans le cas où ils ne reflètent pas un problème dans votre programme.

  1. Avec PROC SQL, je crée une nouvelle table du même nom que la table source.
  2. Dans un data set je réduis la longueur d’une variable

1. Utiliser le même nom de data set en entré et en sortie avec PROC SQL

Pour illustrer le sujet, je vais d’abord créer un data set appelé ONE avec deux variables X et Y.

data one;
x=‘A’;
y=‘B’;
run;

Ensuite je vais créer avec PROC SQL un nouveau data set du même nom ONE qui ne contiendra que la variable X.

proc sql;
create table one as
select x
from one;
quit;

Le message dans la log ressemble à ceci:
WARNING: This CREATE TABLE statement recursively reference the target table. A consequence of this is a possible data integrity problem.

Pour ne plus avoir ce message dans la log, ajouter l’option UNDO_POLICY=NONE

proc sql undo_policy=none;
create table one as
select x
from one;
quit;

Ce cas existe depuis SAS 9.1.3.

2. Réduire la longueur d’une variable dans une étape data

Une solution pour changer la longueur d’une variable est de définir sa longueur dans une instruction LENGTH avant de lire les données avec un SET par exemple.

Depuis SAS 9.2, si la nouvelle longueur est plus petite que l’ancienne un WARNING apparaît dans la log. Ceci est une bonne chose car cela vous permet de repérer d’éventuelles coupures (truncations) de vos données.

Dans certains cas cependant, vous savez pertinemment que le nombre de caractères dans données est au plus X et que dès lors elles ne seront pas coupées en réduisant la longueur.

Vous pouvez vous épargner le warning en encadrant votre étape data des options globales VARLENCHK=nowarn et VALENCHK=warm.

Je vous conseille d’appliquer cette option localement afin de pouvoir continuer à repérer d’autres coupures potentielles non prévues.

data two;
length x $32;
x=‘A’;
run;

data two_a;
length x $1;
set two;
run;

WARNING : Multiple lengths were specified for the variable x by input data set(s). This may cause truncation of data.

options varlenchk=nowarn;
data two_b
length x $1;
set two;
run;
options varlenchk=warn;

Notez cependant, qu’avec SAS 9.1.3 ou SAS 9.2, un warning apparaît dès lors que la variable est donnée dans une instruction BY. L’option VARLENCHK de SAS 9.2 ne vous enlèvera pas le warning. Je vous conseille donc de changer votre longueur au préalable si vous ne voulez pas ce WARNING.

data two_b;
length x $1;
set two;
by x;
run;

WARNING: Multiple lengths were specified for the BY variable x by input data sets and LENGTH, FORMAT, INFORMAT statements. This may cause unexpected results.

Lectures complémentaires :

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Protégé : Quand l’option NOLABEL réserve des surprises !

février 22, 2010

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Protégé : Créer un libname à partir d’un autre libname

janvier 18, 2010

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Indenter ses titres et pieds-de-page dans un fichier PDF

août 2, 2009

Comment couper ses titres et ajouter des indentations dans un fichier PDF avec SAS ? La solution deux petits mots-clés -2n et m précédés d’un symbole défini par vous-même auparavant.

Notez que cette syntaxe fonctionne aussi pour les pieds-de-page.

Si le passage à la ligne fonction avec ODS RTF, l’indentation par contre n’est pas prise en compte.

1. Par défaut un titre est sur une seule ligne

Dans l’exemple qui suit, un titre est donné dans une instruction TITLE.

Ce titre est aligné à gauche (J=L entendez par là justify=left).

Pour faciliter la lecture du programme, le titre est écrit sur plusieurs lignes. Mais au final, tout le texte apparaît sans passage à la ligne.

ods listing close;
title j=l
‘SASHELP.CLASS:’
‘Première Variable: Nom’
‘Seconde Variable: Sex’
‘Troisième Variable: Age’;
ods pdf file=‘C:/sasref/indent_title.pdf’;
proc print data=sashelp.class noobs;
run;
ods pdf close;
ods listing;

title_01_default

2. Passer à la ligne avec ODS ESCAPECHAR et ^-2n

A présent, un passage à la ligne est créé avec le mot -2n.

Pour que SAS n’utilise par ce mot comme un texte devant apparaître dans le titre, ce mot est précédent d’un symbole de son choix (ici un chapeau) défini précédemment avec l’instruction ODS ESCAPECHAR.

ods escapechar=‘^’;
ods listing close;
title j=l
‘SASHELP.CLASS:’
‘^-2nPremière Variable: Nom’
^-2nSeconde Variable: Sex’
^-2nTroisième Variable: Age’;
ods pdf file=‘C:/sasref/indent_title.pdf’;
proc print data=sashelp.class noobs;
run;
ods pdf close;
ods listing;

title_02_linebreak

3. Passer à la ligne et indenter le titre avec ODS ESCAPECHAR, ^-2n et ^m

A présent, l’encre ^m est ajoutée en4ème position dans la première ligne. Cela veut dire que tout le texte qui suit est indenté et débutera en position 4 sous la lettre H de SASHELP.CLASS.

ods escapechar=‘^’;
ods listing close;
title j=l
‘SAS^mHELP.CLASS:’
‘^-2nPremière Variable: Nom’
^-2nSeconde Variable: Sex’
^-2nTroisième Variable: Age’;
ods pdf file=‘C:/sasref/indent_title.pdf’;
proc print data=sashelp.class noobs;
run;
ods pdf close;
ods listing;

title_03_indent

Lectures complémentaires

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Tout sur l’instruction BY

avril 14, 2009

Me rendant compte que l’instruction BY pouvait poser des difficultés lorsqu’on débute avec SAS, j’ai décidé de faire le point sur cette instruction.

1. Une instruction locale

L’instruction BY peut servir dans toutes les étapes data et procédures à l’exception de PROC SQL.

2. Un ordre défini par le nom des variables :

L’instruction BY est suivie du nom des variables servant pour le tri.

Dans un premier temps, les observations sont triées selon les valeurs de la première variable citée, ici SEX. Puis, pour chacune des valeurs prises par SEX (M et F), les données sont triées par NAME.

proc sort data=sashelp.class out=class;
   by sex name;
run;

3. PROC SORT : le premier usage de l’instruction BY : L’instruction BY est logiquement obligatoire dans un PROC SORT. Sinon SAS ne saurait pas dans quel ordre trier les données. Le mot DESCENDING peut-être ajouté pour préciser un ordre décroissant. Ici les données sont d’abord triées par SEX puis par nom en ordre descendant.

proc sort data=sashelp.class out=class;
   by sex descending name;
run;

L’autre manière de trier les données est d’utiliser la procédure PROC SQL.

Idée : Vous aurez souvent un PROC SORT avant d’utiliser l’instruction BY dans une autre procédure ou étape data. Simplifiez-vous la vie en copiant l’insstruction au niveau du PROC SORT et en la collant au niveau de la procédure ou étape data suivante.

4. SAS vous informe si les données ne sont pas triées comme indiqué

L’instruction BY précise à SAS dans quel ordre les données doivent être lues. Si les données ne respectent pas cet ordre, SAS s’arrête et fourni un message d’erreur.

5. L’instruction BY : obligatoire ou optionnelle ?

L’instruction BY est optionelle dans une instruction SET. Utilisée pour empiler les données de deux data sets, elle permettra d’intercaler les observations des deux sources selon leur valeurs au lieu de mettre d’abord toutes les observations du premier data set cité et ensuite toutes les observations du second data set.

L’instruction BY reste pratiquement indispensable avec MERGE puisqu’elle sert à relier les observations de deux data sets par les variables du même nom. Sans elle, les observations du second data set pour les variables du même nom réécrirait sur celle du premier.

L’instruction BY est indispensable avec FIRST et LAST.

6. D’autres usages de l’instruction BY

L’instruction BY peut s’ajouter dans un PROC REPORT. Une option NOBYLINE permettra de changer le titre à chaque nouvelle combinaison de valeurs désignée par l’instruction. Néanmoins la mise à jour du titre par cette approche avec ODS RTF par exemple ne fonctionne pas.

L’instruction BY peut servir dans toutes less procédures (sauf PROC SQL) et notamment dans les procédures statistiques. Voir dans les lectures complémentaire l’usage de l’instruction BY avec PROC FREQ.

Lectures Complémentaires

SAS Online Doc

  • BY-Group Processing in SAS Programs
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Quel format a la pole position? (FMTSEARCH)

septembre 13, 2008

Sous SAS, les formats appliqués à une variable servent, entre autres, à rendre une information un peu plus compréhensible par l’oeil humain. Ces formats peuvent provenir de plusieurs sources. Il est important de savoir laquelle est privilégiée si plusieurs locations contiennent le même nom de format avec le même type (pour variable caractère ou numérique). L’option globale FMTSEARCH se charge de définir l’ordre privilégié.

Les sources disponibles : Par défaut, SAS dispose d’une série de formats (Liste disponible sur la documentation en ligne). L’utilisateur peut lui aussi créer ses propres formats sauvegardés de manière temporaire (dans la bibliothèque WORK) ou permanent (dans des bibliothèques définies par lui-même).

Exemple d’application : vous pouvez définir des formats communs à tous vos projets. Si un projet est particulier, vous pourrez définir un autre format portant le même nom que celui plus globale et demander qu’il soit privilégié.

Rappel : Pour revoir quelques notions de base sur les formats vous pouvez consultez ces trois articles:

Dans cet article, la notion de bibliothèque est requise. Vous pouvez vous reporter à l’article suivant si vous débutez :

1. Par défaut, il y a deux bibliothèques disponibles

La procédure affiche dans la log la valeur prise par les options globales. L’option OPTION réduit l’affichage à la seule option FMTSEARCH.

proc options option=fmtsearch;
run;

Il apparaît alors que les deux bibliothèques considérées par SAS sont WORK en priorité et les formats standards de SAS en second.

FMTSEARCH=(WORK LIBRARY)
List of catalogs to search for formats and informats

En exécutant l’instruction OPTIONS ci-dessous, l’ordre de priorité est changé.

options fmtsearch(library work);

Après une nouvelle exécution de la procédure PROC OPTIONS, le programmeur peut visualiser le changement.

Voir le résultat :

proc options option=fmtsearch;
run;

Contenu de la log :

FMTSEARCH=(LIBRARY WORK)
List of catalogs to search for formats and informats

2. Ajouter des bibliothèques

Des formats sauvegardés dans des fichiers catalogues : Les formats sont stockés dans des fichiers appelés FORMAT CATALOG. Il faudra que ces fichiers portent un nom FORMATS et l’extension pour désigner un catalogue.

Assigner la bibliothèque contenant le catalogue : Pour considérer des FORMAT CATALOG permanents définis par l’utilisateur, il faut désigner le chemin d’accès au fichier par un nom de bibliothèque (instruction LIBNAME) et ajouter ce nom dans la bibliothèque dans la liste de FMTSEARCH.

Exemple : Dans l’exemple qui suit, un format nommé GENDER est sauvegardé dans le fichier FORMATS.CATALOG au niveau de C:/SASREF, chemin pointé par la bibliothèque SASREF.

libname sasref ‘C:/sasref’;

proc format lib=sasref;
value gender 1=‘MALE’
2=‘FEMALE’;
run;

Puis ce format aura la priorité sur tout autre format GENDER créé de manière temporaire.

options fmtsearch=(sasref work library);

Voir le résultat :

proc options option=fmtsearch;
run;

Contenu de la log :

FMTSEARCH=(SASREF WORK LIBRARY)
List of catalogs to search for formats and informats

3. Important : La priorité de la bibliothèque WORK en cas d’omission.

Les deux exemples suivant donnent le même résultat car la bibliothèque temporaire est mise en priorité si elle n’est pas citée.

options fmtsearch=(work sasref library);
options fmtsearch=(sasref library);

WORK n’est pas ignoré comme pourrait le suggérer l’affichage dans la log ou mise en dernier.

Voir le résultat :

proc options option=fmtsearch;
run;

Contenu de la log :

FMTSEARCH=(SASREF LIBRARY)
List of catalogs to search for formats and informat